1、坚持证明标准。试行“认罪认罚从宽”制度并没有降低法定的证明犯罪的标准。只有被告人的有罪供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚。

犯罪嫌疑人、被告人的供述与其他在案证据有矛盾，证明被告人有罪的证据不充分，无法排除合理怀疑的，仍然要贯彻疑罪从无的原则，确保无罪的人不受追究。

2、规范诉讼程序。首先充分保障犯罪嫌疑人、被告人依法享有的辩护权和其他诉讼权利，要向其告知认罪认罚的法律后果，为没有委托辩护人的犯罪嫌疑人、被告人提供法律帮助等。3、加强监督制约。公检法三机关要认真贯彻刑事诉讼法规定的分工负责、互相配合、互相制约的原则，确保认罪认罚案件的办案质量。检察机关应当充分发挥对侦查活动的监督作用，发现有刑讯逼供、暴力取证等违法取证行为的，应当依法提出纠正意见，同时要依法排除非法证据，不得将其作为批准逮捕提起公诉的根据。对于这种行为，法院可以考虑从轻处罚，减轻对犯罪嫌疑人的处罚。