一方面，信号灯设置不合理，并不能改变闯红灯的事实。《道路交通安全法》第三十八条规定：“车辆、行人应当按照交通信号通行；遇有交通警察现场指挥时，应当按照交通警察的指挥通行；在没有交通信号的道路上，应当在确保安全、畅通的原则下通行。”即该规定并没有把信号灯设置不合理作为例外条件，

换句话说，也就是姑且不论信号灯设置是否合理，车辆、行人都有“按照交通信号通行”“按照交通警察的指挥通行”的法定义务。

另一方面，信号灯设置不合理，并不能成为免于处罚的理由。法院审理行政诉讼案件，主要是对被诉具体行政行为的合法性进行审查。与之对应，法院对本案的审查，无疑是针对你是否有闯红灯的违法行为、交警的处罚程序是否合法、处罚标准是否超过法定限额。而《道路交通安全法》第九十条规定：“机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。”鉴于你确已违章，交警的处罚无论从程序还是实体上都是于法有据，也就意味着法院应当维持交警的处罚决定。